La Reserva Nacional Río Clarillo, según Di Castri (1968), posee un clima mediterráneo semiandino que se caracteriza por no tener influencias costeras, pero con tendencias continentales más evidentes. Con respecto a la clasificación climática de Köeppen correspondería al denominado clima templado frío con lluvias invernales (c.s.c.). Estas clasificaciones se aplican a la cuenca de la Reserva en su conjunto, pero se debe tener en cuenta que las diferencias altitudinales, de exposición y pendiente, crean marcadas diferencias locales, dando origen a la presencia de fenómenos “microclimáticos”.
Conforme a los registros de la Estación Agrometeorológica de la Reserva, las temperaturas promedios anuales fluctuan desde una máxima de 21,5 ºC a una temperatura mínima de 7,5 ºC, con una precipitación promedio de 648 mm. con variaciones anuales acentuadas. El régimen pluvial es marcadamente invernal con un promedio de 5 a 6 meses de sequía, como sucede en toda la Región Metropolitana.
En resumen el clima de la reserva es de tipo mediterráneo con unas marcadas estaciones secas/calurosas y unas estaciones más húmedas/frías.
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